Filogeografia de Helicobacter pylori aislado de pacientes de Nariño con distinto riesgo de cáncer gástrico

Guzmán Bastidas, Kevin Andrés (2021) Filogeografia de Helicobacter pylori aislado de pacientes de Nariño con distinto riesgo de cáncer gástrico. Project Report. Universidad de Nariño, San Juan de Pasto.

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Resumen

Helicobacter pylori ha coexistido desde la era de especiación del Homo sapiens en las sabanas Africanas. Durante los procesos de migración humana, la evolución alopatrica origino diferentes subpoblaciones de H. pylori asociadas con las poblaciones humanas asentadas en cada continente. La llegada de los conquistadores a las Américas permitio la interacción de los colonizadores europeos y africanos con los nativos americanos, originando uno de los eventos de mezcla filogeografica más grande de poblaciones humanas modernas, conllevando consigo la mezcla de H. pylori. Comprender el nivel de conservación, adaptación y propagación del genoma de H. pylori desde la evolución, podría brindar potencial información del alto riesgo de cáncer gástrico en el departamento de Nariño. Se analizaron 221 genomas completos de H. pylori de diferentes orígenes filogeograficos del mundo incluidos, 19 genomas del departamento de Nariño, 10 de la zona Andina y 9 de la costa Pacifica. Se compararon 59 aislados de H. pylori de Colombia con 162 aislados obtenidos de África, Europa, Asia y de comunidades de Nativos Americanos del Sur y Norte de nuestro continente. Se utilizó el genoma de la cepa de referencia ATCC 26695 de H. pylori para los alineamiento de genes housekeeping, vacA, alpA y análisis del genoma total realizado en el software Muscle. Para determinar el origen filogeografico de H. pylori se utilizo la Tipificación de Secuencias Multilocus (MLST). La virulencia y capacidad de adherencia de H. pylori asociadas a la coevolución con el humano, como indicadores de conservación, adaptación y propagación se analizaron en los genes vacA y alpA mediante reconstrucción filogenetica, análisis filogenómicos y análisis de ancestría humana. Las poblaciones humanas de la costa pacifica de Nariño presentaron principalmente ancestría Africana, y en pequeña proporción Europea y Amerindia. En contraste la población de la zona Andina indico ancestría proveniente de Nativos Americanos y Europeos. Los análisis evolutivos de los genes housekeeping, vacA, alpA y genoma completo de H. pylori en el departamento de Nariño revelo huellas genómicas con contribuciones de diferentes cepas de los continentes Europeo (hpEurope), Africano (hspWAfrica y hpAfrica2) y curiosamente se encontraron de aislados (hspAmeridian) provenientes de nativos americanos. Los arboles filogenéticos mostraron que las cepas de la costa pacifica al igual que su hospedero conservaron ancestría Africana, sin embargo se observaron pequeñas proporciones de agrupamientos con aislados obtenidos de la zona Andina de Nariño, indicando el surgimiento de un linaje indepediente hspColombia. De hecho se observó que el entrecruzamiento de genomas de H. pylori en el departamento de Nariño dio origen a un complejo mosaico con contribuciones de diferentes cepas ancestrales (hspAmerind, hpAfrica2, hspWAfrica, hpEurope y hspEAsia) producto del mestizaje de sus hospederos desde la colonización de las américas, y agrupandose como un linaje independiente hpsColombia. La diferencia entre los genomas que aun preservan ancestría hspAmerindia, hpEurope, hspWAfrica y hpAfrica2 y genes que han mostrado rápida evolución en Nariño indica que existen varias interacciones gen-microbio con el huésped, producto de una coevolucion adaptativa que le permiten mayor éxito en la colonización y subsecuente adaptación a la mucosa gástrica como lo observado en las poblaciones de bajo riesgo de cáncer gástrico, sin embargo en la zona andina de Nariño, el corto periodo de adaptación y la rápida evolución del genoma de la bacteria, en mas de 500 años despues de la colonización Europea explica, en parte, la alta incidencia de cáncer gástrico en estas poblaciones. Los análisis genéticos de los genes vacA y alpA como marcadores de conservación, adaptación y propagación muestran rutas evolutivas únicas que han sido modulados por el nicho, genética del huésped y la selección inmune, contribuyendo en gran proporción a alto riesgo de cáncer gástrico en la zona andina de Nariño

Tipo de Elemento:	Monografía (Project Report)
Información Adicional:	Asesor: Alvaro Pazos Moncayo, PhD en Ciencia Biomédicas
Palabras Clave:	Helicobacter pylori, Cáncer gástrico, Riesgo de cáncer gástrico--Nariño
Asunto:	Q Ciencias > QH Natural history > QH301 Biology R Medicina > R Medicine (General)
Division:	Facultad de Ciencias Exactas y Naturales > Programa de Biología > Trabajos de grado
Depósito de Usuario:	Funcionario Biblioteca Uno
Fecha Deposito:	19 Nov 2025 13:54
Ultima Modificación:	19 Nov 2025 13:54
URI:	http://sired.udenar.edu.co/id/eprint/17183

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