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Análisis bioinformático de secuencias L1, E6 Y E7 de virus papiloma humano de alto y bajo riesgo más frecuentes en latinoamérica

Angulo Colimba, Andrés Felipe (2014) Análisis bioinformático de secuencias L1, E6 Y E7 de virus papiloma humano de alto y bajo riesgo más frecuentes en latinoamérica. Project Report. Universidad de Nariño, Pasto.

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Resumen

El uso de herramientas de Biología computacional y las secuencias ORF de L1, E6 y E7 reportadas en literatura especializada y en la base de datos de GenBank de los tipos de VPH-AR y VPH-BR más frecuentes en Latinoamérica, permitió analizar las relaciones filogenéticas, variantes de tipos y su distribución geográfica. Se utilizaron rangos de diferente tamaño de fragmento de L1 para construir las filogenias, mientras que el análisis de variabilidad de E6 y E7 permitió identificar mutaciones puntuales para variantes específicas de cada tipo, que posteriormente visualizamos para establecer su distribución en América latina. Se obtuvieron 770 secuencias procedentes de trece países, principalmente Costa Rica, México y Brasil para los tipos de VPH 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 45, 52, 58 y 97. Se identificaron 24 nuevas mutaciones puntuales para todos los tipos excepto VPH 6, 16, 31 y 35, así como mutaciones que permitieron identificar grupos de variantes de acuerdo a la variabilidad exhibida, los cuales se resumieron en mapas de distribución geográfica según el tipo viral. Esta investigación permitió identificar mutaciones puntuales presentes en los diferentes tipos de VPH, posiblemente relacionadas con la persistencia viral. Los datos sobre patrones de distribución geográfica de tipos de VPH, así como de variabilidad intratipo encontrados en este estudio, son esenciales en estudios epidemiológicos tanto para el desarrollo como para la estimación del impacto de las vacunas contra el VPH en CCU y los programas de cribado del cáncer cervical.

Tipo de Elemento: Monografía (Project Report)
Información Adicional: Directora MILENA GUERRERO FLÓREZ BSc. MSc. Microbiología Co-directora CLAUDIA ANDREA SÁNCHEZ BSc. Biólog
Palabras Clave: Bioinformática, Latinoamérica, mutación puntual, ORF, VPH-BR, VPHAR.
Asunto: Q Ciencias > Q Science (General)
Q Ciencias > QR Microbiology
Division: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales > Programa de Biología > Trabajos de grado
Depósito de Usuario: Monitor Biblioteca 3 Quijano Guerrero
Fecha Deposito: 11 Nov 2026 14:12
Ultima Modificación: 11 Nov 2026 14:12
URI: http://sired.udenar.edu.co/id/eprint/19775

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